Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176 ms