Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
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