Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IHHQ14623 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IHHQ14623 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IHHQ14623 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IHHQ14623 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IHHQ14623 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IHHQ14623 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IHHQ14623 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IHHQ14623 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IHHQ14623 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IHHQ14623 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IHHQ14623 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IHHQ14623 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IHHQ14623 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IHHQ14623 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IHHQ14623 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IHHQ14623 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IHHQ14623 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IHHQ14623 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms