Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRIM25Q14258 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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