Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SPIDRQ14159 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SPIDRQ14159 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SPIDRQ14159 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SPIDRQ14159 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SPIDRQ14159 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SPIDRQ14159 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SPIDRQ14159 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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SPIDRQ14159 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SPIDRQ14159 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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