Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms