Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TUBA3CQ13748 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TUBA3CQ13748 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TUBA3CQ13748 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TUBA3CQ13748 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TUBA3CQ13748 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TUBA3CQ13748 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TUBA3CQ13748 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TUBA3CQ13748 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TUBA3CQ13748 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TUBA3CQ13748 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TUBA3CQ13748 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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