Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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ATRQ13535 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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ATRQ13535 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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