Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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FOXE3Q13461 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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FOXE3Q13461 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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FOXE3Q13461 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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FOXE3Q13461 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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FOXE3Q13461 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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FOXE3Q13461 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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FOXE3Q13461 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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FOXE3Q13461 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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FOXE3Q13461 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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