Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms