Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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CHAF1BQ13112 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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