Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HSPB3Q12988 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms