Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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NFIAQ12857 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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NFIAQ12857 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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NFIAQ12857 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
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