Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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