Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
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NUP160Q12769 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
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NUP160Q12769 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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