Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms