Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms