Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms