Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms