Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms