Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms