Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
POLEQ07864 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms