Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms