Protein–RNA interactions for Protein: Q01546

KRT76, Keratin, type II cytoskeletal 2 oral, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT76Q01546 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT76Q01546 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms