Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms