Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms