Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms