Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATMP50440 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATMP50440 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATMP50440 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATMP50440 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATMP50440 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATMP50440 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GATMP50440 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATMP50440 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATMP50440 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATMP50440 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATMP50440 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATMP50440 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATMP50440 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATMP50440 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATMP50440 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATMP50440 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATMP50440 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATMP50440 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATMP50440 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms