Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTBP49356 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms