Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLCP48506 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLCP48506 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLCP48506 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms