Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms