Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH1A3P47895 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms