Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETV4P43268 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ETV4P43268 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETV4P43268 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETV4P43268 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ETV4P43268 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ETV4P43268 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETV4P43268 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETV4P43268 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ETV4P43268 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms