Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM5CP41229 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms