Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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CASQ1P31415 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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CASQ1P31415 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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CASQ1P31415 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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CASQ1P31415 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CASQ1P31415 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CASQ1P31415 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CASQ1P31415 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CASQ1P31415 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CASQ1P31415 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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