Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCAP28676 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCAP28676 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCAP28676 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCAP28676 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCAP28676 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCAP28676 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCAP28676 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCAP28676 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GCAP28676 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCAP28676 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCAP28676 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCAP28676 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCAP28676 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCAP28676 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCAP28676 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCAP28676 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms