Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT1P26358 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms