Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTSSP25774 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms