Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLDCP23378 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLDCP23378 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLDCP23378 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms