Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms