Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms