Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LIG1P18858 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LIG1P18858 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LIG1P18858 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LIG1P18858 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LIG1P18858 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LIG1P18858 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LIG1P18858 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LIG1P18858 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LIG1P18858 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LIG1P18858 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LIG1P18858 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LIG1P18858 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LIG1P18858 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LIG1P18858 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LIG1P18858 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LIG1P18858 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms