Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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