Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT10P13645 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT10P13645 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT10P13645 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT10P13645 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT10P13645 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT10P13645 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
KRT10P13645 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT10P13645 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT10P13645 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT10P13645 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT10P13645 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT10P13645 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT10P13645 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT10P13645 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms