Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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PKHD1P08F94 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
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PKHD1P08F94 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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PKHD1P08F94 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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PKHD1P08F94 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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PKHD1P08F94 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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PKHD1P08F94 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
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PKHD1P08F94 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
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PKHD1P08F94 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
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