Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNN4O15554 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms