Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms