Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBXN8O00124 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBXN8O00124 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBXN8O00124 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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