Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms