Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms